Главная страница MolBiol.ru > Фирмы > Евроген Rambler's Top100
ГЛАВНАЯ · ПРОЕКТ · СПРАВОЧНИК · МЕТОДЫ · РАСТВОРЫ · РАСЧЁТЫ · ЛИТЕРАТУРА · ЗАДАЧИ · FULL TEXT · ОРГ.ВОПРОСЫ · WEB
ФИРМЫ · КАРТА САЙТА · COFFEE BREAK · КАРТИНКИ · РАБОТЫ И УСЛУГИ · БИРЖА ТРУДА · ФОРУМЫ · · Zbio-wiki

Евроген

 

    О компании

    Компания Евроген была основана в 2000 году на базе Лаборатории Генов Регенерации ИБХ РАН (в 2006 году лаборатория сменила название и теперь называется Лабораторией Молекулярных Технологий для Биологии и Медицины ). Основным направлением деятельности компании является разработка и коммерциализация технологий и продуктов для молекулярной и клеточной биологии. В настоящий момент Евроген является одной из ведущих биотехнологических компаний в России, успешно работающей как на внешнем, так и на внутреннем рынке.


    Продукты


    Сервисы

    * только внутри России

    Основные Технологии

    Методы, основанные на эффекте супрессии ПЦР

    Для выполнения сервисов мы активно используем популярные технологии, разработанные в Лаборатории генов регенерации ИБХ РАН и получившие мировое признание. К ним относятся методы, основанные на эффекте супрессии ПЦР (PCR suppression by inverted terminal repeats), такие как:

    • Супрессионная вычитающая гибридизация (Suppression subtractive hybridization, SSH) и зеркально-ориентированная селекция (Mirror orientation selection, MOS) для поиска дифференциально экспрессирующихся генов
    • Метод быстрой амплификации концов кДНК (Step-out RACE) для клонирования полноразмерных кДНК
    • Метод прогулки по хромосоме (genome walking) для поиска регуляторных областей генов

    Метод нормализации кДНК

    К последним нашим разработкам относится метод высокоэффективной нормализации кДНК, использующий уникальные свойства новой термостабильной дуплекс-специфической нуклеазы камчатского краба. Метод был разработан компанией Евроген, в сотрудничестве с учёными ИБХ и ТИБХ РАН.

    Нормализация кДНК приводит к выравниванию концентраций транскриптов в образце тотальной кДНК. В норме каждая клетка многоклеточного организма экспрессирует десятки тысяч генов, при этом количество копий мРНК для каждого гена варьирует от сотен тысяч до единиц. Разница в уровнях экспрессии генов в различных типах клеток существенно осложняет анализ библиотек кДНК путём масштабного секвенирования и функционального скрининга. Использование нормализованных библиотек позволяет значительно повысить эффективность поиска редких генов. В отличие от большинства других методов, наша технология позволяет получать нормализованные библиотеки кДНК, обогащенные полноразмерными последовательностями.

    В настоящее время Евроген предлагает готовые наборы реактивов для нормализации кДНК, а также приготовление нормализованных библиотек на заказ.


    Флуоресцентные белки

    Флуоресцентные GFP-подобные белки являются прекрасными генетически кодируемыми маркерами. Их использование для прижизненного мечения белков, органелл и клеток стало чрезвычайно популярным в последние годы и позволило выйти на новый уровень исследования живой клетки.

    Наша коллекция флуоресцентных белков была создана в сотрудничестве с Лабораторией генов регенерации, занимающей лидирующие позиции в данной области. В частности, именно в этой лаборатории были впервые клонированы гены флуоресцентных белков коралловых полипов (например, DsRed) и членистоногих (например, CopGFP). Сейчас мы можем предложить широкий выбор мономерных и более ярких димерных флуоресцентных белков с различными спектрами флуоресценции, а также уникальные фотоактивируемые белки , позволяющие отслеживать перемещение клеток, органелл и белков in vivo в режиме реального времени. Кроме того, на основе флуоресцентных белков мы разрабатываем новые инструменты для решения различных научных задач, в частности генетически-кодируемые внутриклеточные сенсоры и фотосенситайзеры .







    Избранные публикации

      Эффект супрессии полимеразной цепной реакции и методы на его основе


    1. Buzdin A, Lukyanov S. Stem-loop oligonucleotides as hybridization probes and their practical use in molecular biology and biomedicine. In: Nucleic Acids Hybridization: Modern Applications. Buzdin, Anton; Lukyanov, Sergey (Eds.) XX, 316 p., Hardcover ISBN: 978-1-4020-6039-7, 2007; 85-96
    2. Lukyanov S, Rebrikov D, Buzdin A. Suppression subtractive hybridization. In: Nucleic Acids Hybridization: Modern Applications. Buzdin, Anton; Lukyanov, Sergey (Eds.) XX, 316 p., Hardcover ISBN: 978-1-4020-6039-7, 2007; 53-84
    3. Lukyanov S, Lukyanov K, Gurskaya N, Bogdanova E, Buzdin. A. Selective suppression of polymerase chain reaction and its most popular applications. In: Nucleic Acids Hybridization: Modern Applications. Buzdin, Anton; Lukyanov, Sergey (Eds.) XX, 316 p., Hardcover ISBN: 978-1-4020-6039-7, 2007; 29-51
    4. Rebrikov DV, Desai SM, Siebert PD, Lukyanov SA. Suppression subtractive hybridization. Methods Mol Biol. 2004;258:107-34; PMID: 14970460
    5. Matz MV, Alieva NO, Chenchik A, Lukyanov S. Amplification of cDNA ends using PCR suppression effect and step-out PCR. Methods Mol.Biol. 2003, 221:41-49; PMID: 12703732
    6. Rebrikov DV, Britanova OV, Gurskaya NG, Lukyanov KA, Tarabykin VS, Lukyanov SA. Mirror orientation selection (MOS): a method for eliminating false positive clones from libraries generated by suppression subtractive hybridization. Nucleic Acids Res. 2000, 15;28(20):E90; PMID: 11024192
    7. Diatchenko L., Lukyanov S., Lau Y.-F.C., Siebert P.D. Suppression subtractive hybridization: a versatile method for identifying differentially expressed genes. Method Enzym., 1999, V. 303, 349-380; PMID: 10349654
    8. Shagin D.,Lukyanov K.A., Vagner L.L., Matz M.V. Regulation of average length of complex PCR product. Nucleic Acids Research 1999, V. 27, N 18, e23; PMID: 10471753
    9. Matz M., Shagin D., Bogdanova E., Lukyanov S., Diatchenko L., and Chenchik A. Amplification of cDNA ends based on template-switching effect and step-out PCR. Nucleic Acids Research, 1999, V. 27, 1558-1560; PMID: 10037822
    10. Akopyans N.S., Fradkov A.F., Diatchenko L.B., Siebert P.D., Lukyanov S.A., Sverdlov E.D., Berg D.E. PCR-based subtractive hybridization and differences in gene content among strains of Helicobacter pylori. Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 1998, V. 95, 13108-13113; PMID: 9789049
    11. Lukyanov K.A., Diachenko L, Chenchik A., Nanisetti A., Siebert P.D., Usman N.Y., Matz M.V., Lukyanov S.A. Construction of cDNA libraries from small amounts of total RNA using the suppression PCR effect. Biophis.Biochem.Res.Com., 1997, V. 230, 285-288; PMID: 9016767
    12. Lukyanov K.A., Matz M.V., Bogdanova E.A., Gurskaya N.G., Lukyanov S.A. Molecule by molecule PCR amplification of complex DNA mixtures for direct sequencing: an approach to in vitro cloning. Nucleic Acids Research, 1996, V. 24, 2194-2195; PMID: 8668555
    13. Diachenko, L., Lau Y.-F.C., Campbell A.P., Chenchik,A., Mogadam, F., Huang, B., Lukyanov, S., Lukyanov, K., Gurskaya, N., Sverdlov, E.D., and Siebert, D. Suppression Subtractive Hybridization: A method for generating differentially regulated or tissue-specific cDNA probes and libraries. Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 1996, V. 93, 6025-6030; PMID: 8650213
    14. Lukyanov K.A., Launer G.A., Tarabykin V.S., Zaraisky A.G. and Lukyanov S.A. Inverted terminal repeats permit the average length of amplified DNA fragments to be regulated during preparation of cDNA libraries by polymerase chain reaction. Analytical Biochemistry, 1995, V. 229, 198-202; PMID: 7731798
    15. Siebert P.D., Chenchik A., Kellogg D.E., Lukyanov K.A. and Lukyanov S.A. An improved PCR method for walking in uncloned genomic DNA. Nucleic Acids Research, 1995, V. 23, 1087-1088; PMID: 7731798
    16. Лаунер Г.А., Лукьянов К.А., Тарабыкин В.С., Лукьянов С.А. Простой метод амплификации суммарной кДНК на основе малых количеств суммарной РНК. Молек. генетика, микробиология и вирусология. 1994, N 6, 38-41; PMID: 7537858
    17. Лукьянов С.А., Гурская Н.Г., Лукьянов К.А., Тарабыкин В.С., Свердлов Е.Д. Высокоэффективная вычитающая гибридизация кДНК. Биоорганическая химия. 1994, Т. 20 (6), 701-704.


    18. Флуоресцентные белки


    19. Chudakov DM, Lukyanov S, Lukyanov KA. Tracking intracellular protein movements using photoswitchable fluorescent proteins PS-CFP2 and Dendra2. Nat Protoc. 2007;2(8):2024-32. PMID: 17703215
    20. Shcherbo D, Merzlyak EM, Chepurnykh TV, Fradkov AF, Ermakova GV, Solovieva EA, Lukyanov KA, Bogdanova EA, Zaraisky AG, Lukyanov S, Chudakov DM. Bright far-red fluorescent protein for whole-body imaging. Nat Methods. 2007 Sep;4(9):741-6. PMID: 17721542
    21. Souslova EA, Chudakov DM. Genetically encoded intracellular sensors based on fluorescent proteins. Biochemistry (Mosc). 2007 Jul;72(7):683-97. PMID: 17680759
    22. Merzlyak EM, Goedhart J, Shcherbo D, Bulina ME, Shcheglov AS, Fradkov AF, Gaintzeva A, Lukyanov KA, Lukyanov S, Gadella TW, Chudakov DM. Bright monomeric red fluorescent protein with an extended fluorescence lifetime. Nat Methods. 2007 Jul;4(7):555-7. PMID: 17572680
    23. Souslova EA, Belousov VV, Lock J, Stromblad S, Kasparov S, Bolshakov AP, Pinelis VG, Labas YA, Lukyanov S, Mayr LM, Chudakov DM. Single fluorescent protein-based Ca2+ sensors with increased dynamic range. BMC Biotechnol. 2007 Jun 29;7(1):37. PMID: 17603870
    24. Chudakov DM, Lukyanov S, Lukyanov KA. Using photoactivatable fluorescent protein Dendra2 to track protein movement. Biotechniques. 2007 May;42(5):553, 555, 557. PMID: 17515192
    25. Zhang L, Gurskaya NG, Merzlyak EM, Staroverov DB, Mudrik NN, Samarkina ON, Vinokurov LM, Lukyanov S, Lukyanov KA. UMethod for real-time monitoring of protein degradation at the single cell level. Biotechniques. 2007 Apr;42(4):446, 448, 450. PMID: 17489230
    26. Evdokimov AG, Pokross ME, Egorov NS, Zaraisky AG, Yampolsky IV, Merzlyak EM, Shkoporov AN, Sander I, Lukyanov KA, Chudakov DM. Structural basis for the fast maturation of Arthropoda green fluorescent protein. EMBO Rep. 2006 Oct;7(10):1006-12. Epub 2006 Aug 25. PMID: 16936637
    27. Chudakov DM, Chepurnykh TV, Belousov VV, Lukyanov S, Lukyanov KA. Fast and precise protein tracking using repeated reversible photoactivation. Traffic. 2006 Oct;7(10):1304-10. Epub 2006 Aug 2. PMID: 16889652
    28. Belousov VV, Fradkov AF, Lukyanov KA, Staroverov DB, Shakhbazov KS, Terskikh AV, Lukyanov S. Genetically encoded fluorescent indicator for intracellular hydrogen peroxide. Nat Methods. 2006 Apr;3(4):281-6. PMID: 16554833
    29. Gurskaya NG, Verkhusha VV, Shcheglov AS, Staroverov DB, Chepurnykh TV, Fradkov AF, Lukyanov S, Lukyanov KA. Engineering of a monomeric green-to-red photoactivatable fluorescent protein induced by blue light. Nat Biotechnol. 2006 Apr;24(4):461-5. Epub 2006 Mar 19. PMID: 16550175
    30. Souslova EA, Chudakov DM. Photoswitchable cyan fluorescent protein as a FRET donor. Microsc Res Tech. 2006 Mar;69(3):207-9. PMID: 16538627
    31. Bulina ME, Lukyanov KA, Britanova OV, Onichtchouk D, Lukyanov S, Chudakov DM. Chromophore-assisted light inactivation (CALI) using the phototoxic fluorescent protein KillerRed. Nature Protocols. 2006;1:947-53 doi:10.1038/nprot.2006.89
    32. Bulina ME, Chudakov DM, Britanova OV, Yanushevich YG, Staroverov DB, Chepurnykh TV, Merzlyak EM, Shkrob MA, Lukyanov S, Lukyanov KA. A genetically encoded photosensitizer. Nat Biotechnol. 2006 Jan;24(1):95-9. Epub 2005 Dec 20; PMID: 16369538
    33. Lukyanov KA, Chudakov DM, Fradkov AF, Labas YA, Matz MV, Lukyanov S. Discovery and properties of GFP-like proteins from nonbioluminescent anthozoa. Methods Biochem Anal. 2006;47:121-38; PMID: 16335712
    34. Shkrob MA, Yanushevich YG, Chudakov DM, Gurskaya NG, Labas YA, Poponov SY, Mudrik NN, Lukyanov S, Lukyanov KA. Far-red fluorescent proteins evolved from a blue chromoprotein from Actinia equina. Biochem J. 2005 15;392(Pt 3):649-54; PMID: 16164420
    35. Chudakov DM, Lukyanov S, Lukyanov KA. Fluorescent proteins as a toolkit for in vivo imaging. Trends Biotechnol. 2005 Dec;23(12):605-13; PMID: 16269193
    36. Lukyanov KA, Chudakov DM, Lukyanov S, Verkhusha VV. Innovation: Photoactivatable fluorescent proteins. Nat Rev Mol Cell Biol. 2005 Nov;6(11):885-91; PMID: 16167053
    37. Chudakov DM, and Lukyanov KA. Using photoactivatable GFPs to study protein dynamics and function. In: Jorde, L.B., Little, P.F.R., Dunn, M.J. and Subramaniam, S. (Eds), Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics and Bioinformatics. John Wiley & Sons Ltd: Chichester, 2005; 2129-37
    38. Lukyanov KA, Chudakov DM, Fradkov AF, Labas YA, Matz MV and Lukyanov SA. Discovery and properties of GFP-like proteins from non-bioluminescent Anthozoa. In: Green fluorescent protein: properties and applications. Chalfie, M., Kain, S., Eds. Willey-Liss, New York, 2005; 121-38
    39. Yampolsky IV, Remington SJ, Martynov VI, Potapov VK, Lukyanov S, Lukyanov KA. Synthesis and properties of the chromophore of the asFP595 chromoprotein from Anemonia sulcata. Biochemistry. 2005 Apr 19;44(15):5788-93; PMID: 15823037
    40. Chudakov D.M., Verkhusha V.V., Staroverov D.B., Souslova E.A., Lukyanov S., Lukyanov K.A. Photoswitchable cyan fluorescent protein for protein tracking. Nature Biotechnol., 2004, 22, 1435-1439; PMID: 15502815
    41. Verkhusha VV, Lukyanov KA. The molecular properties and applications of Anthozoa fluorescent proteins and chromoproteins Nature Biotechnol, 2004 Mar;22(3):289-96; PMID: 14990950
    42. Shagin DA., Barsova EV., Yanushevich YG., Fradkov AF., Lukyanov KA., Labas YA., Ugalde JA., Meyer A., Nunes JM.,. Widder EA., Lukyanov SA. and Matz MV. GFP-like proteins as ubiquitous Metazoan superfamily: evolution of functional features and structural complexity. Mol.Biol.Evol., 2004 21(5):841-50; PMID: 14963095
    43. Verkhusha VV, Chudakov DM, Gurskaya NG, Lukyanov S, Lukyanov KA. Common pathway for the red chromophore formation in fluorescent proteins and chromoproteins. Chem Biol. 2004 Jun;11(6):845-54; PMID: 15217617
    44. Чудаков Д.М., Лукьянов К.А. Использование зеленого флуоресцентного белка (GFP) и его гомологов для изучения подвижности белков in vivo Биохимия, 2003, 68 (9):952-957; PMID: 14606935
    45. Chudakov DM, Belousov VV, Zaraisky AG, Novoselov VV, Staroverov DB, Zorov DB, Lukyanov S, Lukyanov KA. Kindling fluorescent proteins - a novel tool for precise in vivo photolabeling. Nature Biotech., 2003, Feb;21(2):191-194; PMID: 12524551
    46. Chudakov DM, Feofanov AV, Mudrik NN, Lukyanov S, Lukyanov KA. Chromophore environment provides clue to "kindling fluorescent protein" riddle. J. Biol. Chem. 2003 Feb 28;278(9):7215-7219; PMID: 12496281
    47. Bulina ME, Verkhusha VV, Staroverov DB, Chudakov DM, Lukyanov KA. Hetero-oligomeric tagging diminishes non-specific aggregation of target proteins fused with Anthozoa fluorescent proteins. Biochem J 2003, Apr 1; 371:109-14; PMID: 12472468
    48. Gurskaya N.G., Fradkov A.F., Pounkova N.I., Staroverov D.B., Bulina M.E, Yanushevich Y.G., Labas Y.A., Lukyanov S. and Lukyanov K.A. A colourless GFP homologue from the non-fluorescent hydromedusa Aequorea coerulescens and its fluorescent mutants. Biochem. J. 2003, Jul 15; 373:403-8; PMID: 12693991
    49. Matz MV, Lukyanov KA and Lukyanov SA. Family of the green fluorescent protein: jorney to the end of the rainbow. Bioessays, 2002, 24(10): 953-9; PMID: 12325128
    50. Fradkov AF, Verkhusha VV, Staroverov DB, Bulina ME, Yanushevich YG, Martynov VI, Lukyanov S, Lukyanov KA. Far-red fluorescent tag for protein labeling. Biochem J. 2002 Nov 15;368(Pt 1):17-21; PMID: 12350221
    51. Labas YA, Gurskaya NG, Yanushevich YG, Fradkov AF, Lukyanov KA, Lukyanov SA, Matz MV. Diversity and evolution of the green fluorescent protein family. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 2002; 99(7):4256-61; PMID: 11929996
    52. Yanushevich YG, Staroverov DB, Savitsky AP, Fradkov AF, Gurskaya NG, Bulina ME, Lukyanov KA, Lukyanov SA. A strategy for the generation of non-aggregating mutants of Anthozoa fluorescent proteins. FEBS Lett 2002 Jan 30;511(1-3):11-4; PMID: 11821040
    53. Bulina M, Chudakov D, Mudrik N, Lukyanov K. Interconversion of Anthozoa GFP-like fluorescent and non-fluorescent proteins by mutagenesis. BMC Biochem 2002 Apr 24;3(1):7; PMID: 11972899
    54. Yarbrough D, Wachter RM, Kallio K, Matz MV, Remington SJ. Refined crystal structure of DsRed, a red fluorescent protein from coral, at 2.0-A resolution. Proc Natl Acad Sci U S A 2001, 98(2):462-467; PMID: 11209050
    55. Gurskaya NG, Fradkov AF, Terskikh A, Matz MV, Labas YA, Martynov VI, Yanushevich YG, Lukyanov KA, Lukyanov SA. GFP-like chromoproteins as a source of far-red fluorescent proteins. FEBS Lett. 2001, 507(1):16-20; PMID: 11682051
    56. Terskikh A, Fradkov A, Ermakova G, Zaraisky A, Tan P, Kajava AV, Zhao X, Lukyanov S, Matz M, Kim S, Weissman I, Siebert P. "Fluorescent Timer": Protein That Changes Color with Time. Science, 2000, V. 290,1585-1588 ; PMID: 11090358
    57. Fradkov AF, Chen Y, Ding L, Barsova EV, Matz MV, Lukyanov SA. Novel fluorescent protein from Discosoma coral and its mutants possesses a unique far-red fluorescence. FEBS Lett., 2000, 18;479(3):127-30; PMID: 10981720
    58. Lukyanov K.A., Fradkov A. F., Gurskaya N.G., Matz M.V., Labas Y.A., Savitsky A.P., Markelov M.L., Zaraisky A.G., Zhao X., Fang Y., Tan W., and Lukyanov S.A. Natural animal coloration can be determined by a non-fluorescent GFP homolog. J Biol Chem, 2000, V. 275, 25879-25882; PMID: 10852900
    59. Matz M.V, Fradkov A.F., Labas Y.A., Savitsky A.P., Zaraisky A.G., Markelov M.L., Lukyanov S.A. Fluorescent proteins from nonbioluminescent Antozoa species. Nature Biotechnology, 1999, V. 17, 969-973; PMID: 10504696


    60. Дуплекс-специфическая нуклеаза и ее применение для нормализации кДНК


    61. Shcheglov A, Zhulidov P, Bogdanova E, Shagin D. Generation of normalized cDNA libraries. In: Nucleic Acids Hybridization: Modern Applications. Buzdin, Anton; Lukyanov, Sergey (Eds.) XX, 316 p., Hardcover ISBN: 978-1-4020-6039-7, 2007; 97-124
    62. Anisimova VE, Rebrikov DV, Zhulidov PA, Staroverov DB, Lukyanov SA, Shcheglov AS. Renaturation, activation, and practical use of recombinant duplex-specific nuclease from Kamchatka crab. Biochemistry (Mosc). 2006 May;71(5):513-9. PMID: 16732729
    63. Altshuler IM, Zhulidov PA, Bogdanova EA, Mudrik NN, Shagin DA. Application of the DSNP-method for analysis of single nucleotide polymorphisms in the human genes. Bioorg Khim. 2005;31(6):627-636 (in Russian)
    64. Zhulidov PA, Bogdanova EA, Shcheglov AS, Shagina IA, Wagner LL, Khazpekov GL, Kozhemyako VV, Lukyanov SA, Shagin DA. A Method for the Preparation of Normalized cDNA Libraries Enriched with Full-Length Sequences. Bioorg Khim. 2005;31(2):186-94 (in Russian)
    65. Zhulidov PA., Bogdanova EA., Shcheglov AS., Vagner LL., Khaspekov GL., Kozhemyako VB., Matz MV., Meleshkevitch E., Moroz LL,. Lukyanov SA, and Shagin DA. Simple cDNA normalization using kamchatka crab duplex-specific nuclease. Nucl. Acids. Res. 2004 32: e37. PMID: 14973331
    66. Shagin DA, Rebrikov DV, Kozhemyako VB, Altshuler IM, Scheglov AS, Zhulidov PA, Bogdanova EA, Staroverov DB, Rasskazov VA, Lukyanov S. A novel method for SNP detection using a new duplex-specific nuclease from crab hepatopancreas. Genome Res. 2002 Dec;12(12):1935-42. PMID: 12466298
Дата последней модификации: 30/07/13

ГЛАВНАЯ · ПРОЕКТ · СПРАВОЧНИК · МЕТОДЫ · РАСТВОРЫ · РАСЧЁТЫ · ЛИТЕРАТУРА · ЗАДАЧИ · FULL TEXT · ОРГ.ВОПРОСЫ · WEB
ФИРМЫ · КАРТА САЙТА · COFFEE BREAK · КАРТИНКИ · РАБОТЫ И УСЛУГИ · БИРЖА ТРУДА · ФОРУМЫ · · Zbio-wiki

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

molbiol.ru  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама

molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов   Rambler