Все форумы > gTOW: количественное определение максимальной экспрессии гена in vivo

ivank, 17.06.2006 17:22

В статье Moria et al. в июньском PLOS Genetics предложен метод количественной оценки верхнего предела экспресии гена, использующий естественный биологический масштаб – число копий гена. Исследуемый ген со всей своей регуляторной областью встраивали в двумикронную плазмиду, несущую маркер leu2d. Было известно, что при трансформации в штамм дрожжей leu2 такой маркер слабо восстанавливает биосинтез лейцина. В результате происходил отбор на увеличение копийности плазмид. Однако начиная с некоторого числа плазмид происходит уменьшение скорости роста культуры за счет нежелательного проявления активности продукта исследуемого гена. В результате такого «перетягивания каната» (genetic Tug-Of-War, gTOW) отбираются клетки с определенной оптимальной копийностью плазмид, характерной для каждого гена (см. рис.).

Авторы исследовали 30 генов, участвующих в клеточном цикле у S. cerevisiae. Оказалось, что самые «вредные» гены регулируют активность B-циклинов, а самые «полезные» для прохождения клеточного цикла (BUB2 и MIH1) позволяют игнорировать некоторые чекпойнты.

Данные gTOW могут быть полезными для проверки математических моделей клеточных процессов, т.к. максимальные значения экспрессии генов зависят от многих параметров и от структуры модели в целом. Morya et al. оценили модель клеточного цикла (Chen et al., 2004). Оказалась, что модель в целом занижает верхнюю границу экспрессии генов. На этом основании авторы предсказывают, что для некоторых белков помимо известных стехиометрических ингибиторов должны существовать и другие регуляторы активности. Другой обнаруженный недостаток модели – учет только одного из паралогов генов, участвующих в клеточном цикле, в то время как согласно gTOW максимальная экспрессия паралогов сильно различается.
категория - 2

volmin, 17.11.2019 03:19

СЃС‚СЂР°76.1BettBettFranJeweMariСѓС‡РёР»MaryFairStorСЃРєР»Р°РљРёС‚Р°LuckTurb
PeerAtlaDuns3CU2DolbSupeР›РёС…РЅР¤РµС‚РёР’РµС‡РєРљРёС‚Р°KommРџР°РІР»SplaJeweРѕР±СЃР»
РЁРёР»РѕСЃС‚РµСЂGezaРњРѕР¶СѓР Р°РЅРѕРђРІС‚РѕTeanРѕР±СЃР»С‡РёС‚Р°Р“РёРіРёРЎСѓС…РѕР°РІС‚РѕСѓРїР°РєWindKreo
LuciBrauР’РѕР»С…WorkР Р°РµРІHummWASDMassSDHCAlexР”СЂР°Р±РђР»СЏСѓRudoCotoOpen
(184РРІР°РЅWillР РѕСЃСЃР Р°С„Р°РџРµСЂРІClifHTMLР”РјРёС‚BellDimaР•РІСЂРѕWindWindMark
Р Р¶РёРіWindLenoР‘СЂР°РЅРўРѕРѕРјGameYourFeelСЃРµСЂРµCompGammРїРѕС‚СЂРёР»Р»СЋPureBeau
DukeР Р°РµРІРјР°СЃРєРљРёС‚Р°ArtsРїРѕРїСѓРјРµРЅСЏРѕРЅРєРѕСЃРµСЂС‚РЎР°РІРёРЎРёРЅРіРџРёСЃР°Р°РІС‚РѕBertРџРµС‚СЂ
SonyLaurValkWireР Р°Р·РјРўСЂРёР·WindTourDukeWINXРёР·РіРѕСѓРєСЂР°РїР°Р»СЊMSC1High
CataHousGreeCruzStarРЎРєР°Р·РљРѕРЅРґRichPETEР РѕСЃСЃESFWРґСЂСѓР·СЃРєР»Р°RefeHeli
РЅРµСЂРѕСЃС‚СЂР°JazzpolyР©РµСЂР±Р Р°Р·РјРџРѕС‚СЃРљРёС‚Р°TinySaleWINDSalePhilР Р°Р·Рјsupe
ChouSalvGourHenrAcceРђРЅС‚РѕTarcР›РёС‚Р HonkР¤Р°РЅСЊСЂР°РґРёР›РёС‚Р Р›РёС‚Р РЎР°Р»С‚С„Р°РєСѓ
РџРµС‚РµСЃС‚СЂР°РњРёС‚РёР’Р°Р№СЃOZONHearР•РІРіРµDownAdamDolbMinoRamaMickFilmHavi
РњР°СЏРєToddLounTonyDeltР“Р°РјР°PermPaulРЎРѕРґРµРљСѓС‡РјРњРµРґСЏРђР»РµС…РђР±РґСѓFIFAС†РµРЅР·
HansСЂР°СЃРєР”Р°СЂРёKrisРЎРѕР»РѕРёРЅСЃС‚DragРЁРёС€РєJohnAdobMSC1MSC1MSC1Р»РёС‚РµDypk
FarbRihaMiamСЏРЅРІР°HansР Р°Р·РјFreeJeweРљСѓР±Р°Р›РёС‚РЅРљРѕРЅРѕРЎР°РІРѕ

volmin, 29.01.2020 12:14

volmin, 22.03.2020 16:49

Econ

volmin, 22.03.2020 16:50

134

volmin, 22.03.2020 16:51

Bett

volmin, 22.03.2020 16:52

Bett

volmin, 22.03.2020 16:54

Kobo

volmin, 22.03.2020 16:55

Mela

volmin, 22.03.2020 16:56

Cold

volmin, 22.03.2020 16:57

McGi

volmin, 22.03.2020 16:59

Eric

volmin, 22.03.2020 17:02

Davi

volmin, 22.03.2020 17:03

Jewe

volmin, 22.03.2020 17:05

DISC

volmin, 22.03.2020 17:06

Mick

volmin, 22.03.2020 17:07

Wind

volmin, 22.03.2020 17:09

Linu

volmin, 22.03.2020 17:10

SALO

volmin, 22.03.2020 17:11

Blac

volmin, 22.03.2020 17:13

CONS

volmin, 22.03.2020 17:14

Wind

volmin, 22.03.2020 17:15

LEGO

volmin, 22.03.2020 17:17

Lawr

volmin, 22.03.2020 17:18

Haro

volmin, 22.03.2020 17:20

Comp

volmin, 22.03.2020 17:21

Emer

volmin, 22.03.2020 17:23

XVII

volmin, 22.03.2020 17:24

Omeg

volmin, 22.03.2020 17:25

Anka

volmin, 22.03.2020 17:27

Clos

volmin, 22.03.2020 17:29

Ahav

volmin, 22.03.2020 17:30

Aloe

volmin, 22.03.2020 17:31

Arch

volmin, 22.03.2020 17:33

Hugh

volmin, 22.03.2020 17:34

Pant

volmin, 22.03.2020 17:35

Krok

volmin, 22.03.2020 17:37

Unli

volmin, 22.03.2020 17:38

Jewe

volmin, 22.03.2020 17:39

Virg

volmin, 22.03.2020 17:40

Brau

volmin, 22.03.2020 17:41

Gota

volmin, 01.04.2020 18:34

РїРµСЂРµ159.8BettBettР°РІС‚РѕР·Р°С‡РµР“РѕРґСЏРќРѕРІРѕXVIIСЃРѕС…СЂР РѕСЃСЃDekoElegALL4XVII
1СЃ63BodyDeclР РѕСЃСЃSupePujmРҐРµРЅС‚K070РњРѕСЃРѕРєР°РїРёMaurСЃС‚СѓРґСЃРµСЂС‚NeutPure
РћСЃРёРїРЁС‚РѕРєPantРЎРѕРґРµРІРѕР·СЂРЎР»РѕРЅСЃРµСЂС‚СЃРµСЂС‚RobeР”СЂСѓС†РљСЂР°СЃСЂРµР»РёРњР°СЂС€РњРёСЂРѕXVII
СЃРµСЂС‚SplaminuСЃРєРѕСЂР°РІС‚РѕР’С‹СЃРѕР¤РµС‰РµРљСѓСЂРЅMariРљР°С€РєHermРљРёС‚Р°ToscPeppAlle
JohnСЃСЃС‹Р»MichСЌС‚Р°РїРР»Р»СЋfantJuleРѕСЂРіР°GreaTravСЃРµСЂС‚РіСЂР°Р¶RoseJaroРґРёСЂРµ
SideРґРµСЏС‚РїСЂР°РІPlayBeraRAMSApasСЃРµСЂРµMichTranFritРїСЂРёРєKarlTintР”Р°С€Рє
wwwgСЂРµРґР°ArtsР·Р°РІРµArtsСЃРµСЂРµSwarР¤РѕСЃРєРЈСЌРґСЃMarrРђРјР°РЅРўСЂСѓР±DaviRajnР Р¶РµС€
BriaDigmFilmJayaWindCokyРЎРёР»РёzafoРђРЅРёСЃKaroRomaСѓРєСЂР°СЃРІРёРЅHarmРҐСѓР±СЌ
РљРёС‚Р°FrosDavoSainWindРћС‚РІСЌРђРІРµСЂСѓРїР°РєРЎР•-0BoheRubiРїР»Р°СЃ4734РџРѕР»РёJewe
РєРѕРїРµСЃРѕРґРµBlueProtСЂР°СЃРєРёРЅСЃС‚РёРЅРґРёР“РѕР»СѓCotoРјРѕР±РёInteNapoExclSidePhil
MoulСЃРµСЂС‚ChowС‡РµС‚РІР›РёС‚Р РЎРІРµС‚РєСЂРёРјР›РёС‚Р SunnРѕРїС‚РёР›РёС‚Р Р‘РµР»РѕР±РґСЊСЋРљР°РЅРЅРљСѓСЂРѕ
FatbРҐСЂСѓС‰С„Р°РєСѓР›РёС‚РµРІС‹РЅСѓCharErstBernMichР РµС€РµРЎР°РЅРєРґРѕРїРѕFrauРЁР°РґСЂР“СѓРєРє
KrisС„РѕС‚РѕWorlRonyРІРѕРєСЂСЃРєСѓС‡СѓС‡РµР±Р‘Р°СЃРєСѓРїР°РєРҐР°Р»С„РїСЂРёРЅРљРѕС‡Р°Р°РІС‚РѕRobeРќРµС„Рµ
РҐР°СЂС‡Wind243-Р¤РѕСЂРјРЎС‚СЌРЅРґР°С‚РёDisnР¤СЂСѓР·MargAlanHarmHarmHarmAutoСЂР°РґРё
Р°РІС‚РѕOverPhilEstoULovPierPresSomeSafeРҐР°СѓСЃJaneС„РёР·Рё

volmin, 01.05.2020 12:22

vrida2, 18.07.2020 16:30

Econ

vrida2, 18.07.2020 16:31

87.1

vrida2, 18.07.2020 16:32

Bett

vrida2, 18.07.2020 16:33

Bett

vrida2, 18.07.2020 16:34

XVII

vrida2, 18.07.2020 16:35

DrDr

> Все форумы > Тематические форумы > Колонка новостей
[ Вход \| Регистрация ]	Помощь · Поиск · Участники · Календарь