Господа, подскажите, пожалуйста, как правильно перевести "gap penalty"? Заранее признательна
[ 18.06.2004, 20:47: Сообщение отредактировано: Aglaya ]
 
| |
[ Вход | Регистрация ]
|
Как перевести "gap penalty"?
Anonymous, 19.12.2001 19:22
Anonymous, 19.12.2001 21:27
в каком контексте?
Anonymous, 20.12.2001 02:17
Если речь идет о "штрафе" за пропущенный нуклеотид или аминокислоту (при выравнивании), то так и перевести - штраф за пропуск нуклеотида (аминокислоты)
Anonymous, 20.12.2001 10:53
"Штраф за гэп"
Гэп лучше не переводить! А то любой ламер сможет понять, чем мы занимаемся:-))
Гэп лучше не переводить! А то любой ламер сможет понять, чем мы занимаемся:-))
Anonymous, 20.12.2001 20:27
Огромное спасибо - и у меня ряд встречных вопросов, вынесла отдельным заголовком
Anonymous, 21.12.2001 01:16
Ув. zelensky
В этой конференции желательно указывать на какой именно язык Вам нужен перевод.
Если на ламерский, то тогда верно, а если на русский, то "штраф на делецию".
В этой конференции желательно указывать на какой именно язык Вам нужен перевод.
Если на ламерский, то тогда верно, а если на русский, то "штраф на делецию".
Anonymous, 21.12.2001 10:33
Спасибо большое, но я не совсем поняла - что значит ламерский язык? Дело в том, что я два года живу в Израиле, а биоинформатикой как таковой занялась примерно три недели тому назад, правда, до этого работала со статистикой в биологии, СУБД, и проч., т.е. к лохам себя не отношу,и образование соответствующее имеется, но, очевидно, немного отстала. А за делецию - спасибо, наконец-то я для себя уяснила, в чем дело.
Anonymous, 21.12.2001 17:38
А вот и ни фига, делеция тут не причем. А ламерский перевод - это название одного нового понятия старым - по аналогии. Гэп и делеция - это разные вещи, откройте любой учебник. Тем более при компьютерном выравнивании, как правильно указал а11, аминокислотной или нуклеотидной последовательностей, где вообще речи о делециях или инсерциях не идет. А gap - кстати раньше переводили как "выпетливание" в приложении ко вторичной структуре РНК.
Anonymous, 21.12.2001 18:44
VLAD2, наверное, очень хорошо знает как ламерский, так и русский язык (не говоря уж о биологии):
штраф НА делецию.
может быть, ввести еще штраф ПРО бесплатный проезд?
штраф НА делецию.
может быть, ввести еще штраф ПРО бесплатный проезд?
Anonymous, 22.12.2001 19:57
ОК, в учебнике написано ("Биология" Вилли):делеция - это выпадение какого-либо участка хромосомы. Возможно, что этот же термин применим и к последовательности, или секвенции нуклеотидов. Очевидно, делеция - от deletion. Gap переводится как разрыв, дизъюнкция, перерыв. Очевидно, в каком-то плане можно использовать термин делеция в кач-ве перевода этого самого gap. Значит, окончательный вариант - штраф за пропущенную аминокислоту, правильно?
Anonymous, 22.12.2001 20:13
Dear Zelensky,
свободный выбор синомимов в языке, на который Вы переводите фразу, возможен только в том случае, если за данным синонимом не закрепилось устойчивых выражений. Поскольку термин делеция означает именно выпадение участков хромосомы и ничего больше (напр., нельзя сказать: делеция зуба, правда?), этот термин нельзя использовать для перевода слова gap.
Действительно, как правильно заметил один из "Гостей", лучше уж привести прямую транскрипцию переводимого слова в надежде получить понятный термин - гэп. Особенно учитывая всеобщее знание основ английского языка в русскоязычных научных кругах и способность русского языка к легкому захвату иностранных слов).
Переводя gap как "делеция", Вы введете в заблуждение и себя, и окружающих.
Для пущей убедительности сошлюсь свой большой опыт коммерческого перевода научно-технической информации
свободный выбор синомимов в языке, на который Вы переводите фразу, возможен только в том случае, если за данным синонимом не закрепилось устойчивых выражений. Поскольку термин делеция означает именно выпадение участков хромосомы и ничего больше (напр., нельзя сказать: делеция зуба, правда?), этот термин нельзя использовать для перевода слова gap.
Действительно, как правильно заметил один из "Гостей", лучше уж привести прямую транскрипцию переводимого слова в надежде получить понятный термин - гэп. Особенно учитывая всеобщее знание основ английского языка в русскоязычных научных кругах и способность русского языка к легкому захвату иностранных слов).
Переводя gap как "делеция", Вы введете в заблуждение и себя, и окружающих.
Для пущей убедительности сошлюсь свой большой опыт коммерческого перевода научно-технической информации
Anonymous, 22.12.2001 22:34
А11, ваш ответ я зафиксировала сразу, когда вы ответили первый раз на мой вопрос. Профессионала сразу видно. Если не секрет - кто вы и чем занимаетесь по жизни? Я так поняла, что вы живете в Москве. Я тоже когда-то занималась очень интенсивно переводами, но волей судьбы на несколько лет выпала из обоймы, а теперь пытаюсь, не очень, правда, успешно, вернуться в нужное русло. Поскольку молекулярную биологию приходится изучать по англ. источникам, а в прежней жизни я ею не занималась - только во время учебы, то и чувствую себя неуверенно. Все-таки хочется осмыслить термины и на родном языке, это проблематично. Открыла для себя этот форум - просто как подарок. Насколько я поняла из ваших рекомендаций Марике, желающей поступить на каф-ру, вы работаете в МГУ, правильно я поняла? Прошу прощения за многословность, как-то получилось.
Anonymous, 23.12.2001 01:35
Да, я имею отношение к МГУ (учусь на последнем кусре), Онкоцентру (делаю там диплом) и биотехнологической компании Integrated Genomics, Inc (прошу прощения за невольную рекламу).
Anonymous, 23.12.2001 19:25
Экие вы однако нервные!
Мой сарказм относится к сообщению "guest" от 20-12-2001 09:53 MSK
Тут, как обычно, студенты пытаются скрыть отсутствие знаний обилием наукообразных слов.
К сожалению у меня сейчас нет русскоязычной литературы, но на мой взгляд "штраф на делецию" это устоявшийся термин, попробуйте посмотреть в документации к пакету "VOSTORG"
ftp://ftp.bionet.nsc.ru/pub/biology/vostorg/vostorg.zip
Разобъясняю:
Штраф накладывают НА..., штрафуют ЗА...
Все в этом мире относительно, делеция в хромосоме может быть размером в 1 нуклеотид или в 100 кв.
Выравнивание последовательностей производят путем введения вставок/делеций. (см. guest: Tема: Что значит штраф за пропущенный нуклеотид? написано 20-12-2001 23:23 MSK)
"gap penalty" это штраф на делецию любого размера в нуклеотидной или аминокислотной последовательности.
Во многих методах выравнивания кроме "gap penalty" есть еще и "gap length penalty" (Clustal V, Clustal W, Martinez/Needleman - Wunsch), кроме того в Clustal W существует штраф на концевую делецию, что и делает этот метод пригодным для выравнивания последовательностей сильно различающихся по длине.
Перевод "штраф за пропуск нуклеотида" неверный.
P.S. a11 "большой опыт коммерческого перевода" - В том то и беда, как потом такое читать?
Мой сарказм относится к сообщению "guest" от 20-12-2001 09:53 MSK
Тут, как обычно, студенты пытаются скрыть отсутствие знаний обилием наукообразных слов.
К сожалению у меня сейчас нет русскоязычной литературы, но на мой взгляд "штраф на делецию" это устоявшийся термин, попробуйте посмотреть в документации к пакету "VOSTORG"
ftp://ftp.bionet.nsc.ru/pub/biology/vostorg/vostorg.zip
Разобъясняю:
Штраф накладывают НА..., штрафуют ЗА...
Все в этом мире относительно, делеция в хромосоме может быть размером в 1 нуклеотид или в 100 кв.
Выравнивание последовательностей производят путем введения вставок/делеций. (см. guest: Tема: Что значит штраф за пропущенный нуклеотид? написано 20-12-2001 23:23 MSK)
"gap penalty" это штраф на делецию любого размера в нуклеотидной или аминокислотной последовательности.
Во многих методах выравнивания кроме "gap penalty" есть еще и "gap length penalty" (Clustal V, Clustal W, Martinez/Needleman - Wunsch), кроме того в Clustal W существует штраф на концевую делецию, что и делает этот метод пригодным для выравнивания последовательностей сильно различающихся по длине.
Перевод "штраф за пропуск нуклеотида" неверный.
P.S. a11 "большой опыт коммерческого перевода" - В том то и беда, как потом такое читать?
Anonymous, 23.12.2001 19:48
Сегодня я сидела в биб-ке как в старые добрые времена и набрела в "The Encyclopedia of Molecular Biology" на следующее определение делеции (ведь, насколько я понимаю, делеция все же произошла от deletion???): DELETION - the loss of a segment of DNA. The extent of a deletion may vary from a single base to a section of a chromosome with the genes contained therein. А Gap Penalty, с которого все началось определяется след. образом:The penalty in a scoring algorithm used in alignment of two sequences when one of these has a deletion or the other has an insertion. Т.е. все-таки чутье меня не очень подвело и гэп с делецией сопоставимы, т.е. делеция - это гэп в более широком понимании. Теперь относительно использования на или за применительно к штрафу. Зависит от процесса. Жаль, нет Ожегова или Даля под рукой. Не очень хорошо еще ориентируюсь в самом процессе появления делеции, но, очевидно, штраф за использование делеции? Ведь, насколько я поняла, можно, для лучшего выравнивания, добавлять и удалять отдельные основания???
Anonymous, 23.12.2001 22:08
Господа,
а in vitro вы как переводите?
Может, я тормоз какой англоманский, но, imho, gap penalty переводить вообще нет смысла...
а in vitro вы как переводите?
Может, я тормоз какой англоманский, но, imho, gap penalty переводить вообще нет смысла...
Anonymous, 23.12.2001 23:00
Я все же настаиваю на своем варианте. Еще раз повторю (другими словами), что в английском языке понятие deletion гораздо шире, чем в русском, где оно означает удаление нуклеотидов _путем мутаций_ из _хромосомы_. При выравнивании речь не идет о мутациях (т.е. о происхождении gap), это "вневременной" анализ последовательности, поэтому русский термин здесь не применим.
Dear Zelensky,
поймите, что бессмысленно приводить аргументацию из _англоязычных_ источников! При всем моем ...гмм... отношении к VLAD2, его аргументация про VOSTORG гораздо убедительнее, но... поскольку я нигде больше такой фразы не встречал, мне кажется, что они просто допустили ту же ошибку, что и собираетесь допустить Вы
Dear Zelensky,
поймите, что бессмысленно приводить аргументацию из _англоязычных_ источников! При всем моем ...гмм... отношении к VLAD2, его аргументация про VOSTORG гораздо убедительнее, но... поскольку я нигде больше такой фразы не встречал, мне кажется, что они просто допустили ту же ошибку, что и собираетесь допустить Вы
Anonymous, 23.12.2001 23:53
Велик и могуч......
Gap - первое значение "пропасть" имя сущ., может быть так же провал, брешь, пробел. В современном английском часто употребляется как "разница" между чем то ,с оттенком усиления (некая значимая разница или перепад). Знаменитое "mind the gap" - в Лондонском метро.
Penalty - вынужденная плата, (штраф - слово немецкое ;-) )
При сопоставлении последовательностей (alignment) часто гомологичные(!) участки находятся на разном расстоянии от начала гена(либо относительно друг друга) "выравнивая" вам приходится иметь дело с "лишними" участками (вставка или делеция - с какой стороны посмотреть),правда, это лишь частный случай. Все немножко сложнее если плясать от аминокислотной последовательности. Увеличивая гомологию в одном месте , имеете головную боль, куда пристроить образовавшуюся РАЗНИЦУ.
Вот и получается что за все в этой жизни нужно платить...
Вскорости о науке будем только на ломаном английском общаться.
Gap - первое значение "пропасть" имя сущ., может быть так же провал, брешь, пробел. В современном английском часто употребляется как "разница" между чем то ,с оттенком усиления (некая значимая разница или перепад). Знаменитое "mind the gap" - в Лондонском метро.
Penalty - вынужденная плата, (штраф - слово немецкое ;-) )
При сопоставлении последовательностей (alignment) часто гомологичные(!) участки находятся на разном расстоянии от начала гена(либо относительно друг друга) "выравнивая" вам приходится иметь дело с "лишними" участками (вставка или делеция - с какой стороны посмотреть),правда, это лишь частный случай. Все немножко сложнее если плясать от аминокислотной последовательности. Увеличивая гомологию в одном месте , имеете головную боль, куда пристроить образовавшуюся РАЗНИЦУ.
Вот и получается что за все в этой жизни нужно платить...
Вскорости о науке будем только на ломаном английском общаться.
Anonymous, 24.12.2001 01:52
Господа, огромное всем спасибо. Собственно, я даже не столько хотела для себя уяснить как перевести на русский язык (он, увы, для меня на данном этапе и, боюсь, навсегда, не более, чем хобби), сколько понять что это такое. Вроде поняла, поскольку все это время интенсивно вгрызалась в эту новую и очень интересную для меня область (биоинформатику). Что касается использования ломаного английского - то это все же несколько преувеличенно. Можно, конечно, пытаться (и небезуспешно) найти в русском языке аналоги, могущие заменить пресловутые гэп и делецию, как это делают во Франции и, например, в Израиле (общеизвестный компьютер во Франции - вовсе и не компьютер, то же относится и к ивриту), но это будет смахивать все же на персонажа у Войновича, прототипом к-рого явл. Солженицын, к-рый вместо телевизора употреблял слово гляделка и т.д. Хорошо это или плохо - но англ. язык на данном этапе явл. интернациональным яз., а Волга понятно что делает. Поэтому будем изучать англ., но, как завещал Т.Г.Шевченко - и свого не цурайтесь, думаю, переводить нет смысла. СПАСИБО за внимание и за приятную компанию!!!Если у меня возникнут новые вопросы - а они возникнут - то я знаю - к кому обращаться!!!
Anonymous, 24.12.2001 11:46
А может по простому, более конкретно: уменьшение критериальной функции, используемой при компьютерном выравнивани последовательностей ДНК или белка, за использовании пропуска, или разрыва в тексте последовательности. Без биологии, чисто по компьютерному.
Anonymous, 24.12.2001 15:05
Ну наконец-то я понял, о чем идет речь!
Anonymous, 25.12.2001 13:39
В тему: А никто не знает как перевести ( и понять) термин Curvature в применении к ДНК и РНК? Интуитивно вроде догадался, а точного и научного перевода не знаю.
Anonymous, 25.12.2001 18:25
приколись, Бивис
Anonymous, 04.01.2002 16:12
Переводить gap как делеция нельзя, так как делеция - это то, что происходит НА САМОМ ДЕЛЕ, а гэп появляется У ВАС В КОМПЬЮТЕРЕ при сравнении последовательностей. НЕ СМЕШИВАЙТЕ НАСТОЯЩУЮ РЕАЛЬНОСТЬ С ВИРТУАЛЬНОЙ!
Anonymous, 04.01.2002 20:16
Переводить gap как делеция неграмотно, т.к. делеция - это уже устоявшийся термин изменения ДНК, происходящий НА САМОМ ДЕЛЕ, а гэп - это то, что получилось с последовательностью ПОСЛЕ КОМПЬЮТЕРНОЙ ОБРАБОТКИ. Не путайте Божий дар с яичницей, т.е. фактические изменения в ДНК с виртуальной реальностью. Всех благ.
Anonymous, 09.01.2002 12:32
А что же мне делать с базяком!
vrida, 11.05.2020 20:39
vrida2, 01.09.2020 23:42
watchesbiz, 28.06.2021 14:00
?
watchesbiz, 08.09.2021 16:47
nigoal123, 01.12.2021 08:56
When you have decided on your topic and you’ve narrowed it down to something more specific think about how you can make this article stand out.
If you are writing an article about something that other people are also writing about them to get a good impression try to be unique in how you approach the material.
If you are writing an article about something that other people are also writing about them to get a good impression try to be unique in how you approach the material.
vrida2, 07.03.2022 10:21
vrida2, 09.03.2022 10:31
vrida2, 29.05.2022 18:42
vrida2, 03.11.2022 02:44
watches89, 06.12.2023 08:32
Owning a luxury means more than just owning a prestigious accessory; It’s about investing in a piece that can be passed down from generation to generation. These timepieces hold their value extremely well, and some even appreciate in value over time, making them attractive investment options. For watch connoisseurs, collecting luxury watches has become a lifelong passion, with each purchase adding to the value and uniqueness of their collection.
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.