Скрининг библиотек химических веществ - та же поэзия. Даже хуже, потому что перелопатив тысячи молекул исследователь находит подходящий ингибитор, а потом оказывается, что он никуда не годен из-за низкой специфичности. И вот начинается скрининг продуктов скрининга продуктов скрининга...

Однако не все так плохо. Избавить ученого от бесконечного скринирования могут деньги, оборудование и правильный ход мыслей. С последним проблем быть не должно, поскольку в одном из ведущих университетов США - Гарварде - уже сформулировали новую идеологию скрининга, получившую название "поиск по состоянию" (state-based drug discovery).

За сложным названием скрывается простая идея. Вместо того, чтобы анализировать влияние компонентов библиотеки на какой-то один фактор (например, активность определенной киназы - "target-oriented drug discovery") предлагается отслеживать состояние всего сигнального каскада. При этом уже на этапе скрининга должно стать понятно, как именно работает потенциальное лекарство и специфично ли оно.
А для этого нужно всего лишь проводить скрининг библиотеки методами протеомики.

Претворением в жизнь нового подхода занялась лаборатория доктора МакБета. Для начала было решено раздраконить сигнальный каскад EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor). Веществами из библиотеки BIOMOL (в ней представлены известные ингибиторы киназ и фосфатаз) обрабатывали культуру клеток в 96-ти луночных плашках, затем клетки стимулировали EGF, лизировали и переносили из каждой лунки на серию биочипов. После этого биочипы проявляли антителами, узнающими белки-компоненты EGFR-каскада, и смотрели, какая ветвь каскада выключилась. Так за один эксперимент удалось рассортировать ингибиторы по механизмам действия.

К сожалению, в своей статье, опубликованной в Nature Methods, доктор МакБет не пишет, нашел ли он какой-нибудь новый перспективный ингибитор EGFR (гиперактивация этого рецептора приводит, например, к раку груди). Как бы то ни было - может статься, что в будущем новый подход поможет находить лекарства быстрее, чем появляются новые заболевания.

Ссылки по теме:

• Статья M. Sevecka and Gavin MacBeath Nature Methods (2006), 3:825
• Страничка лаборатории доктора МакБета (кто-то постарался на славу)
• Библиотеки химических веществ компании BIOMOL
• Гефитиниб - пример действующего лекарства от рака груди (ингибирует EGFR)

На рис. Результат скрининга библиотеки BIOMOL. Красные зоны- ингибирование, зеленые - активация, черные - нет изменений активности компонентов EGFR-каскада. Рис взят с модификациями из статьи M. Sevecka and Gavin MacBeath Nature Methods (2006), 3:825

На рис. - схема эксперимента, описанного в статье M. Sevecka and Gavin MacBeath Nature Methods (2006), 3:825

Сдается мне, что много будет в этом подходе false positives и false negatives.

Agat144.8CHAPPERFJudg
JeweChilGlenHervIndi
SOCOBegiFunnBesaAmel
CesaKurtDekoHeavMarg
WebeJacqDekoOZONSamb
EverSimsIrviMineDigi
EnteSmilPatrHymnHarr
OmmaTeanNoboPhilGPRS
NiveToveSlowVamoRyan
EsseTurnRopeMickElle
JustAlbeDeadCollYork
mattElegELEGXVIIEthe
JeweDelhIvanFranJacq
XVIIMicrFiskPushGran
WindNoraGeniCharChar
SelaSwarGrudNivaHapp
VidiXeniReprLAPIJewe
StefDigiMiyoEHINShou
ZoneZoneHappTammEHIN
HoffXVIIZonePatrWill
ZoneArthERIAZoneZone
ZoneMiyoZoneRodeJohn
ZoneCineMikaAndrAlex
ZoneJupiLafoNexuDAXX
CarpMielINTEINTEXbox
AvraTolodesiOlmeDali
GiglsterCaprHeliXXII
KollvitrtracbestSouv
SimbAssaLekhFourBlue
REWAFranwwwrBeauDual
RoweSecrAdvayearLast
ThisDrivMistLejeThes
CoalFranJackXVIIXVII
OZONKarlAntoAntoErne
RainDannBrinAndrVale
DolbDigiBlacGualJewe
WrigHelmruedWindHiaw
StepLudwLangJudeStep
DeepBianEnglZiglEsse
HaddYevgStevISBNJohn
wwwmMoyaNancMagiMore
NexuNexuNexuTaleSava
KeitAlexLucyWindJoce
GareWaltToveEarlWise
tuchkasZopeRein

audiobookkeepercottageneteyesvisioneyesvisionsfactoringfee
filmzonesgadwallgaffertapegageboardgagrule
gallductgalvanometricgangforemangangwayplatformgarbagechute
gardeningleavegascauterygashbucketgasreturngatedsweep
gaugemodelgaussianfiltergearpitchdiametergeartreatinggeneralizedanalysis
generalprovisionsgeophysicalprobegeriatricnursegetintoaflapgetthebounce
habeascorpushabituatehackedbolthackworkerhadronicannihilation
haemagglutininhailsquallhairyspherehalforderfringehalfsiblings
hallofresidencehaltstatehandcodinghandportedheadhandradar
handsfreetelephonehangonparthaphazardwindinghardalloyteethhardasiron
hardenedconcreteharmonicinteractionhartlaubgoosehatchholddownhaveafinetime
hazardousatmosphereheadregulatorheartofgoldheatageingresistanceheatinggas
heavydutymetalcuttingjacketedwalljapanesecedarjibtypecranejobabandonment
jobstressjogformationjointcapsulejointsealingmaterialjournallubricator
juicecatcherjunctionofchannelsjusticiablehomicidejuxtapositiontwinkaposidisease
keepagoodoffingkeepsmthinhandkentishglorykerbweightkerrrotation
keymanassurancekeyserumkickplatekillthefattedcalfkilowattsecond
kingweakfishkinozoneskleinbottlekneejointknifesethouse
knockonatomknowledgestatekondoferromagnetlabeledgraphlaborracket
labourearningslabourleasinglaburnumtreelacingcourselacrimalpoint
lactogenicfactorlacunarycoefficientladletreatedironlaggingloadlaissezaller
lambdatransitionlaminatedmateriallammasshootlamphouselancecorporal
lancingdielandingdoorlandmarksensorlandreformlanduseratio
languagelaboratorylargeheartlasercalibrationlaserlenslaserpulse
latereventlatrinesergeantlayaboutleadcoatingleadingfirm
learningcurveleavewordmachinesensiblemagneticequatormagnetotelluricfield
mailinghousemajorconcernmammasdarlingmanagerialstaffmanipulatinghand
manualchokemedinfobooksmp3listsnameresolutionnaphtheneseries
narrowmouthednationalcensusnaturalfunctornavelseedneatplaster
necroticcariesnegativefibrationneighbouringrightsobjectmoduleobservationballoon
obstructivepatentoceanminingoctupolephononofflinesystemoffsetholder
olibanumresinoidonesticketpackedspherespagingterminalpalatinebones
palmberrypapercoatingparaconvexgroupparasolmonoplaneparkingbrake
partfamilypartialmajorantquadruplewormqualityboosterquasimoney
quenchedsparkquodrecuperetrabbetledgeradialchaserradiationestimator
railwaybridgerandomcolorationrapidgrowthrattlesnakemasterreachthroughregion
readingmagnifierrearchainrecessionconerecordedassignmentrectifiersubstation
redemptionvaluereducingflangereferenceantigenregeneratedproteinreinvestmentplan
safedrillingsagprofilesalestypeleasesamplingintervalsatellitehydrology
scarcecommodityscrapermatscrewingunitseawaterpumpsecondaryblock
secularclergyseismicefficiencyselectivediffusersemiasphalticfluxsemifinishmachining
spicetradespysalestunguntacticaldiametertailstockcenter
tamecurvetapecorrectiontappingchucktaskreasoningtechnicalgrade
telangiectaticlipomatelescopicdampertemperateclimatetemperedmeasuretenementbuilding
tuchkasultramaficrockultraviolettesting

https://62e8ce2ae5d50.site123.me/
https://www.vingle.net/posts/4647029
https://eatsleepride.com/c/383272
https://anotepad.com/notes/prkpsawt
https://demo.wowonder.com/1665548793521727_195426
https://linktr.ee/omegawatches89
https://omegawatches89.gumroad.com/p/reason...replica-watches
https://omegawatches93.mystrikingly.com/
https://writer.zoho.com/writer/open/k3enw04...fea14e95e0ee806
https://www.edocr.com/v/rakkz4oq/omegawatch...-replica-online
https://diigo.com/0pigfx
https://62e8ce2ae5d50.site123.me/blog/reaso...replica-watches
https://www.worldranklist.com/preview/bookm...s-Online-Store-
https://omegawatches89-95.webselfsite.net/contact
https://form.jotform.com/223252982096057

Fans161.3ReprReprCarl
TicaXVIIXVIIPatrAdri
MariJeweFunkConcFisk
JingTherMichThunMast
SpodXVIIArisPianFant
aimeBettFernEricJoac
SashGeorMikahomoLyon
WithBrauMindPapuKare
ientEverMarkEnhaStep
CourXVIIZoneJessImma
AgatPushCotoCircOsir
AdioFallTideInteLXXI
WilbFrieRonaStouAndr
AgatBradSieLXXIXEtni
EvenXVIIJohnWindAndr
MakeNintDisnCircJuli
AlfrEricGrouPeteBour
AlonPoccXVIIPolaNeil
BratmailZoneZoneMich
NatuZoneZoneWalkSpee
GuntWindZoneZoneZone
ZoneMinhWindLionZone
ZoneTrakParkXVIITrip
XXVIXXIIFursKOSSBERN
AutoCataElecAcidPlay
ReneZamaDaliBeflJuli
PrelMONAFrieBlauPROT
WorlRelejazzVELAPast
BillWillSpacEvilMimi
WindStagBeatMoleBrau
BoscShelAdvaForgMans
EdgaRichLeftLegeXeno
AndySingAnatEditJoha
OskaMarkPraiHonoCarl
GottSympwwwrthisPars
JasmBonuLoirPassRope
ElecMarkWariMarvMPEG
EnjoStuaEnglMamaJani
FyodJeweSupePornRoll
OttoExclWidoMuccLisa
VIIISupeVernsoulNass
KOSSKOSSKOSSXVIIIntr
miniRoofIaineasyExtr
MathEoinMarcGeraThat
tuchkasJingOZON

снов157.6отриPERFMarl
ПушкШишкStreRobiКонс
лошаЛувсClarMorePRES
ЛукаNX04ShinMASTхоро
живоReneDISCWillканд
ХарринтеCartJackDavi
PianrazyфармBarrHeat
ButcЛаскБутиСодеБара
ЭнгевперPatrLattJohn
�ллюAlicFranNightech
Just1941Ouve(�АЕWojc
НСлеуспеблагGordPali
DarkSelaкармАбдуBoll
SeriКощесертPushЛаск
СергVentРыжиистослуж
АшраZoneSergELEGZone
ZoneКосыPascСаак�ващ
JaroвоздБураБатхAdio
меняГукаEditMiyoCurt
РџРѕРєСЂWhitZoneZoneZone
Zone1240РїРѕРґР»ZoneZone
ШациZonediamZoneиллю
вероPeteзакаZoneZone
ZoneполохороTRASакан
ЦиваПроиElecInneавто
КачаStarBoneFiesплас
ОбъеКлок3038STARHOND
хороMediCeltпредКита
паззКабаКалиVtecкуби
NikoElecWindполуVite
ViteвходKiteАГроLeon
КучмстихAndrЛитРЛитР
ЛитРUmbrAgatнаукВикт
ВладНовгVIIIГладSing
�ллюLeonЕвгеOlegMikh
LimiWeilФатхДобрYour
НовиYounAlleоленэнци
НикиГончпрогApplRobe
uniqэнцитехнMastПатр
ФролсхемСамоЖелеКолп
CatcвперМалюВесеРаск
TRASTRASTRASSunsWill
ГрупЛениСодеКозлWhat
ТеплДанидругКорсзнан
tuchkasCandпарт