Михаил, 25.06.2010 12:55
Здравствуйте, Господа! Подскажите пожалуйста, где можно скачать последовательности РНК заданного набора организмов для построения филогенетического дерева (какие базы данных использовать и т.д.)? Какие именно РНК лучше для этого взять? Нужно сравнить деревья, построенное по РНК и по белкам.
Andrew, 25.06.2010 17:03
Каких РНК? Каких организмов? В чем цель работы?
Михаил, 25.06.2010 18:06
Организмы - бактерии, 30 видов (отбиралось примерно по виду из каждого семейства, так, чтобы покрыть весь таксон Eubacteria). Цель работы - построить по последовательностям РНК дерево и сравнить его с деревом, построенным по последовательностям белков этих же организмов (есть подозрение, что при работе с белками программа допускает систематическую ошибку). Какие для этого лучше использовать РНК, я не знаю. В принципе, я только что нашел человека, он мне в понедельник согласился объяснить, так что пока тема не актуальна.