Полная версия страницы  English  

Перевод из Coarse-Grained в All-Atom модель

Ktkachev, 02.02.2015 18:15
Здравствуйте!

Не уверен, что правильно выбрал раздел, но, вроде бы, подходит больше всего.
Я пытаюсь написать ПО для моделирования третичной структуры РНК. В результате работы моей программы получается набор координат центров масс нуклеотидов, входящих в данную РНК. Далее, я хочу преобразовать полученную модель к полноатомной в формате pdb, при условии что мне известны координаты атомов в конкретном нуклеотиде относительно центра масс. Однако, в следствии вращения РНК цепочки, просто восстанавливать координаты всех атомов не получается, а так же, неверно восстанавливаются направления связей в цепочке. Я попытался вращать набор атомов в различных проекциях что бы подобрать нужный поворот, но мои попытки не увенчались успехом и направления связей все так же восстанавливаются неверно.
Может быть, кто-нибудь знает, есть ли возможность сделать то, что я хочу?
Поиск по литературе не дал результатов.

С уважением, Кирилл
guest: great , 31.10.2018 18:13
This is actually the kind of information I have been trying to find. Thank you for writing this information.
http://www.healthtipstoday.net
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.