Полная версия страницы  English  

Хранение срезов FFPE

4815162342, 18.03.2020 13:55
Доброго времени суток!
Подскажите, можно ли хранить срезы FFPE ткани, залив их каким-нибудь ксиленом/гептаном? Может можно использовать RNAlater? В дальнейшем планируем выделять рнк и ставить пцр
dk, 18.03.2020 15:37
Не понял, зачем вы хотите заливать срезы, там паче ксиленом? Если вы имеете в виду Инвитрогеновский RNAlater для сохранения РНКи именно для парафиновых срезах - он вам уже никак не поможет. Храните стёкла в прохладном месте и в темноте. Для выделения РНКи из срезов куча китов есть, как соберётесь выделять - так и определитесь.
4815162342, 18.03.2020 16:42
(dk @ 18.03.2020 16:37)
Ссылка на исходное сообщение  Не понял, зачем вы хотите заливать срезы, там паче ксиленом? Если вы имеете в виду Инвитрогеновский RNAlater для сохранения РНКи именно для парафиновых срезах - он вам уже никак не поможет. Храните стёкла в прохладном месте и в темноте. Для выделения РНКи из срезов куча китов есть, как соберётесь выделять - так и определитесь.


Ну, у нас проблемы с микротомом, а образцы в парафиновом блоке. Было бы проще нарезать их и хранить. Ксиленом - потому что им собираемся депарафинизировать
dk, 21.03.2020 20:39
Так может проще блок и хранить? Там и объём материала достаточный. Или вам надо изучить срезы и уже потом ПЦРить? Вот честно - я просто не вижу смысла в лишних операциях с "консервированием". Если бы был нативный материал - а так у вас уже и формалин, и парафинова проводка выполнена. Залив пробы ксиленом вы всё равно не избавитесь от броуновского движения, которое будет "ломать" макромолекулы. Лучше просто высушенные пробы хранить. Можете даже заморозить в азоте - там уж точно сохранность будет максимальная. Хотя, вроде как современные наборы для выделения из FFPE хорошо "вытягивают" НК без каких-то сложновыдуманных "танцев с бубном".
EfimovO, 22.03.2020 22:16
Сначала синтез, анализ, а потом хранение, очевидно, на какую-то длительную перспективу. Так я понимаю? Все подряд не собирать.
- Э -, 23.03.2020 23:22
(4815162342 @ 18.03.2020 14:55)
Ссылка на исходное сообщение  Доброго времени суток!
Подскажите, можно ли хранить срезы FFPE ткани, залив их каким-нибудь ксиленом/гептаном? Может можно использовать RNAlater? В дальнейшем планируем выделять рнк и ставить пцр

ДНК да
рНК нет
- Э -, 23.03.2020 23:25
(4815162342 @ 18.03.2020 14:55)
Ссылка на исходное сообщение  Доброго времени суток!
Подскажите, можно ли хранить срезы FFPE ткани, залив их каким-нибудь ксиленом/гептаном? Может можно использовать RNAlater? В дальнейшем планируем выделять рнк и ставить пцр

Может можно использовать RNAlater

нахера поздно пить Боржоми
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.